“营改增”是“十二五”时期中国财税体制改革的一项重要任务。6月28日，楼继伟在关于2014年中央决算的报告中提出，今年力争全面完成“营改增”。
不过，楼继伟8月底向全国人大常委会作今年以来预算执行情况报告时又表示，适时将建筑业，房地产业、金融业和生活服务业纳入“营改增”试点。
从“今年力争完成”到“适时纳入”，根据《第一财经日报》9月7日的报道，楼继伟表述的细微变化，意味着今年营改增恐难以收官，或将推迟到明年上半年出台前述四大行业的“营改增”政策。
郝小军表示，建筑业完成“营改增”税制改革后，“78号文”对污水垃圾处理项目的影响将有所减少，但对存量项目影响依旧。
环境服务业商会建议，应从上游的建筑业开始改革增值税政策，以免处于下游的污水垃圾处理企业无法取得增值税进项税额抵扣。且污水垃圾处理行业实行增值税新政策，应以从事建安工程的建筑业全面实施后的时间作为执行时点。水协排水委则认为，对于营改增尚未完成的地区，可先不征收增值税。
“78号文”此次对违规企业重拳整治。规定已享受本通知的增值税即征即退政策的纳税人，因违反税收、环境保护的法律法规受到处罚(警告或单次1万元以下罚款除外)的，自处罚决定下达的次月起36个月内，不得享受本通知规定的增值税即征即退政策。
在9月1日的座谈会上，住建部官员及水协排水委都表示，城镇污水处理厂超标处罚应属行政处罚范畴，税制应该是基本制度，税制处罚与超标处罚相联系是不合理的。
郝小军分析称，企业受罚一次便三年不得翻身未免过于严苛。很多地方排水系统尚未实现雨污分离，加上管网管理不到位，导致污水处理企业的进水大多超标，而“进水超标”在环保局给予处罚时却不视作可容情的理由。
楼继伟认为，叫苦企业主要是市政单位，“因为不专业化运作，就没有开增值税发票的需求，直接就排掉了，而且长期享受免税政策。这些单位目前还对政策调整还不太适应。”
与众多悲观的国内环保企业不同，胜科认为“78号文”是利好信号。这家2005年进入中国水务市场的新加坡企业，向界面新闻记者表示，统一增值税缴纳办法，表明中国环保市场已经加速向市场驱动的机制转型。
胜科(中国)投资有限公司首席执行官廖伟豪向界面新闻记者表示，“胜科从第一个污水处理项目开始就按照《中华人民共和国增值税暂行条例和实施细则》缴纳17%的增值税。‘78号文’对于像严格履行纳税义务的企业是一个有利的政策。”
财政部税政司官员在座谈会上明确表示，将对全国城镇公共污水处理企业实施78号文的影响做详细的评估，在全面评估测算后出台补充措施。
这也符合众多环保企业的要求。根据E20环境平台的调研，环保企业希望，在充分调研税负或影响的单价的基础上，将税收反应于成本中，并出台相应实施细则，进一步细化、落实即征即退新政策的执行手续、流程、周期和其规范化。
环保服务业商会认为，污水垃圾处理行业属于公益事业和环境服务业，应比照现代服务业6%的增值税税率计征，并明确退税时限，做到即征即退。此外，因先征后退的增值税而增加的“城建税及教育费附加”等费用也应全部返还;增值税返还部分不应纳入所得税的计税范围，在计算应纳所得税额时应作为不征税收入从收入总额中扣除，防止重复征税。
对于处罚措施，E20环境平台认为应根据具体情况完善相应处罚制度。水协排水委表示，城镇污水处理厂的税制制度和超标处罚不应挂钩。
此外，E20环境平台建议启动地方水价调价机制，促使污水处理服务费相应增加以抵减税收影响;地方政府按照这次影响的变化给企业补贴;为了保持PPP项目推行的力度或者推行的进度，中央财政对PPP项目进行变相的补贴。