（二）国家对如何确定光伏电站计税面积的规定并不明确
《条例》规定，土地使用税以纳税人实际占用的土地面积为计税依据，土地占用面积的组织测量工作，由省、自治区、直辖市人民政府根据实际情况确定。但《条例》并未明确实际占用土地的性质以及判断标准。
此外，目前国家政策允许光伏企业就升压站、变电站、太阳板支架用地采用“点征”方式办理征地手续，太阳板覆盖的部分可不办理征地手续（实际也无法办理，多采取租地方式）。但是是否按照征收土地的面积作为计税面积，实践中各地的税务机关的计税标准并不统一，其中一种观点认为，光伏电站的太阳板遮盖部分并未改变原有土地用途，“点征”面积为电站实际使用的土地，因此可以按照点征面积计税；但也有观点认为，土地使用税以纳税人实际占用的土地面积为计税依据，太阳板实际遮盖部分也属于电站占地，因此应按电站全部占地面积计税。据笔者了解，目前光伏发电企业一般都能接受税务机关按照征地面积计征土地使用税，但是对于就太阳板实际覆盖部分征税往往都难以接受。
对此问题，南方周末记者曾在2012年进行了深入调研，并于当年8月发表的《电站戈壁淘金：馅饼，还是陷阱？》的报道中进行了披露，尽管国家积极鼓励和发展太阳能发电产业，但是在实践中已“变异”成为地方招商引资的筹码。如果开征土地使用税，据相关人士估计，其每年的纳税将是过去的5倍。国家发改委能源研究所的相关专家认为，电站占用的大都是戈壁、盐碱地等不毛之地，如果开征土地使用税后相关的土地费用比招标（征地）还要高，是不合理也是与国家政策相悖的。
笔者认为，开征土地使用税的主要目的是为了合理利用城镇土地，强化土地使用税调节职能，引导纳税人珍惜土地资源，缓解土地供求矛盾。但是，大型地面光伏电站一般都是建在离城镇较为偏远的地域，其实际上是对荒地的有效利用，并不属于土地使用税本意所调整的范围。因此，为更好的促进光伏发电产业的发展，国家有必要系统清理城镇工矿区规划划分标准，对明显不合理的应予纠正；在执行层面，对于目前已落入城镇工矿区的光伏电站，在国家对“土地使用税的计税面积”出台解释性文件前，税务机关应作出对纳税人有利的理解，即对于光伏电站按照征地面积计征土地使用税。
（三）国家目前对光伏发电产业并无明确的土地使用税优惠政策
目前，各省、自治区和直辖市政府对于光伏发电产业一般都有相关促进性的政策规定。但是对于城镇土地使用税这一税种而言，国税总局和财政部并未针对光伏发电企业出台专门的税收优惠规定。
2014年底，国务院下发的《关于清理规范税收等优惠政策的通知》（国发【2014】62号），要求对全国税收政策进行全面清理。2015年5月10日，国务院出台《关于税收等优惠政策相关事项的通知》（国发【2015】25号）暂停了62号文的清理工作。但25号文同时明确各地区、部门今后制定出台新的优惠政策，凡涉及税收或中央批准设立的非税收入的，应报国务院批准后执行。笔者理解，地方政府制定税收优惠的权限已被国务院上收，此前已经出台的相关税收优惠政策的时效性也受到一定的限制。今后光伏企业如再想取得土地使用税的优惠政策，必须获得国务院的批准。