使用时的效率相差无几
PEFC虽单元工作温度仅为60℃到120℃，但为了促进形成离子，使用了铂催化剂，并且需要使用一氧化碳去除装置，结构较为复杂。据称PEFC的部件个数为SOFC的2倍。
不过，SOFC由于工作温度较高，因此要保持能源效率，需要一直处于运转状态。另一方面，PEFC由于工作温度较低，因此从启动到发电用时较短，也可频繁启动及停运。东芝燃料电池系统公司董事永田裕二说：“从实际使用情况考虑，PEFC和SOFC在效率方面相差无几。”
东芝公司于2009年上市了PEFC型ENE-FARM，之后于2012年3月推出了新机型。通过提高铂催化剂等的性能，使贵金属催化剂的使用量减少了20％。并且，还通过提高氢和氧的扩散性，提高了单元的发电效率，将单元数量减少了15％。将所发电力从直流电转变为交流电的逆变器（功率调节器）也与控制电路板实现一体化，减少了部件个数。并改进了系统整体设计，使成本削减了3成。
松下公司今年4月开始销售的机型建议零售价为199.5万日元，比之前的机型降低了76万日元。其中，调整脱硫材料及催化剂使用量起了较大作用。松下将在定期维护等时了解到的用户使用状况，及各地区不同的燃气特性建立了数据库，并进行了分析，然后根据分析结果进行了改良。另一方面，松下装置公司燃料电池部经理加藤玄道指出：“2012年供货量达到1万台，市场正日益扩大，由于有望实现量产效应，因此得以降低了成本。”
最近很明显的动向是PEFC的弱点正在稳步得到克服。另一方面，SOFC基本性能部分的改良也有进展。
日本大阪燃气公司、爱信精机公司和京瓷公司合作，于2012年3月共同开发出SOFC型ENE-FARM，并于4月上市。开发时所面临的最大课题，就是确保电池堆的耐久性。由于SOFC工作时的温度高达700℃左右，因此随着温度的变化，有时单元会出现裂缝。大阪燃气等对这种情况进行了改良。还有一个问题，就是如果从单元中提取电力的集电体因氧化而劣化，电阻会随之而增大。因此采取了对集电体表面进行涂布加工等对策。
“PEFC有发展前途”
针对2种方式的发展前景，德勤咨询公司经理尾山耕一认为：“PEFC比较有发展前途。”日本自民党议员于今年6月组织了“促进实现以FCV为中心的氢社会研究会”（原环境大臣小池百合子担任会长），丰田汽车公司等民营企业也参与其中，德勤咨询目前担任着企业秘书处的工作。
丰田和本田公司计划在2015年、日产汽车公司计划在2017年上市FCV市售车型。各公司均将采用PEFC型燃料电池。通过应用在车用燃料电池领域开发的技术，有望实现PEFC家用燃料电池的进一步技术革新，及通过生产工序通用化降低部件成本。
而且，经济产业省也计划在2015年之前建设100处FCV氢基础设施。PEFC家用燃料电池的难点在于燃气脱硫及重整工序较为复杂，但如果能够直接供应氢，便可大幅削减部件个数。
另一方面，日本的电力系统改革也对SOFC起到了推动作用。现在，电力公司不收购燃料电池生成的电力。但如果制度发生变化，普通家庭可以销售燃料电池所发电力，那么选择发电效率较高的SOFC的消费者也许会增加。大阪燃气生活事业部商品技术开发部SOFC开发组经理岩田伸表示：“我们将兼顾PEFC和SOFC同时予以发展。”
2011年7月，经济产业省制定了“力争到2016年，包括设置施工费在内，将设备采用费用降到70万到80万日元”的方针。岩田经理说：“我们已有了进一步提高SOFC发电效率等降低价格的创意。”随着氢社会逐渐具备现实意味，家用燃料电池似乎也将发生进一步的技术革新。